CEET dlouhodobě spolupracuje s veřejným sektorem a partnery z průmyslu především prostřednictvím společných vědeckovýzkumných projektů a smluvního výzkumu. Unikátní zázemí sestávající se ze špičkového přístrojového vybavení poskytuje vědeckým pracovníkům zázemí a potenciál pro výzkum napříč čtyřmi definovanými výzkumnými oblastmi a zajišťuje efektivní přenos metod a technologií z vědecké do komerční sféry. Objem spolupráce s průmyslem a veřejnou sférou tvoří více než polovinu získaných prostředků v rámci celé univerzity. Vybrané příklady spolupráce jsou její ukázkou.